自上個世紀(jì)70年代以來，發(fā)達(dá)國家系統(tǒng)治理農(nóng)業(yè)面源污染，以流域為目標(biāo)逐步實施農(nóng)業(yè)投入氮、磷總量控制，經(jīng)過了約20年，取得了較明顯成效。進入新世紀(jì)后，我國也開展了形式多樣、卓有成效的農(nóng)業(yè)面源污染治理試驗示范工作。實踐證明，農(nóng)業(yè)面源污染可防可治。

測土配方施肥成效顯著。2005年農(nóng)業(yè)部啟動了測土配方施肥項目。這項技術(shù)以土壤測試和肥料田間試驗為基礎(chǔ)，根據(jù)作物需肥規(guī)律、土壤供肥性能和肥料效應(yīng)，在合理施用有機肥料的基礎(chǔ)上，提出氮、磷、鉀及中、微量元素等肥料的施用數(shù)量、施肥時期和施用方法。圍繞“測、配、產(chǎn)、供、施”等環(huán)節(jié)，調(diào)節(jié)和解決作物需肥與土壤供肥之間的矛盾，有針對性地補充作物所需的營養(yǎng)元素，實現(xiàn)各種養(yǎng)分平衡供應(yīng)，滿足作物生長發(fā)育的需要，實現(xiàn)提高肥料利用率和減少用量，提高作物產(chǎn)量，改善農(nóng)產(chǎn)品品質(zhì)，節(jié)省勞力，節(jié)支增收的目的。2005年～2013年中央財政累計投入近百億元，建設(shè)測土配方施肥項目縣（場、單位）2498個，技術(shù)推廣面積14億畝次，三大糧食作物氮肥當(dāng)季利用率達(dá)到33%，比測土配方施肥補貼項目實施前提高了5個百分點，投入量日趨合理。中國農(nóng)業(yè)大學(xué)研究團隊分析，從2004年到2013年，我國糧食增產(chǎn)了28.2%，同期我國化肥用量增長了27.5%，這是自上世紀(jì)60年代我國開始大范圍施用化肥以來，糧食增產(chǎn)速度首次跑贏肥料增長速度。

農(nóng)藥統(tǒng)防統(tǒng)治效果明顯。以促進農(nóng)作物安全生產(chǎn)﹑減少化學(xué)農(nóng)藥使用量為目標(biāo)，采取生態(tài)控制、生物防治、物理防治、科學(xué)用藥等環(huán)境友好型技術(shù)來控制有害生物的有效措施。如保護天敵進行生態(tài)控制，使用生物農(nóng)藥制劑、性誘劑等生物防治措施，使用誘蟲燈、防蟲網(wǎng)等物理防治措施，努力減少化學(xué)農(nóng)藥，在必須使用時也優(yōu)先鼓勵使用低毒低殘留、環(huán)境友好型農(nóng)藥。截至2013年，農(nóng)業(yè)部已在全國設(shè)立了106個國家級綠色防控示范區(qū)，輻射帶動綠色防控面積達(dá)5億畝以上，實施區(qū)農(nóng)藥使用量下降30%以上。累計推行專業(yè)化統(tǒng)防統(tǒng)治12億余畝次，小麥、水稻重大病蟲統(tǒng)防統(tǒng)治覆蓋率達(dá)到25%左右，項目區(qū)農(nóng)藥使用量降低15%~25%。

畜禽養(yǎng)殖糞污集中化處理明顯加快。我國相繼出臺了《畜禽規(guī)模養(yǎng)殖污染防治條例》、《畜禽養(yǎng)殖業(yè)污染物排放標(biāo)準(zhǔn)》、《畜禽養(yǎng)殖業(yè)污染防治技術(shù)規(guī)范》等法規(guī)和標(biāo)準(zhǔn)。農(nóng)業(yè)部門針對畜禽糞污處理，先后開展了全國畜禽標(biāo)準(zhǔn)化規(guī)模養(yǎng)殖和沼氣工程建設(shè)等項目，使得規(guī)模養(yǎng)殖場糞污處理設(shè)施條件明顯改善，糞污處理能力明顯提高。針對周邊配套農(nóng)田面積不足、污水產(chǎn)生量大且處理費用高的傳統(tǒng)養(yǎng)殖場，從源頭減少污水產(chǎn)生，并通過污水氧化塘處理后就近農(nóng)田利用和固體糞便堆肥處理后異地利用的方式，實現(xiàn)養(yǎng)殖場糞污減量和資源利用。在周邊配套農(nóng)田、山地、果林或茶園充足的養(yǎng)殖場，養(yǎng)殖糞水經(jīng)過沼氣處理或氧化塘處理后的肥水澆灌農(nóng)田、固體糞便堆肥后還田或種植經(jīng)濟作物等，通過畜禽廢棄物的資源化利用，實現(xiàn)糞便污水的零排放和有機物、氮磷等營養(yǎng)物質(zhì)的循環(huán)利用。

秸稈綜合利用有序推進。2013年全國秸稈總產(chǎn)量為9.64億噸，可收集資源量8.19億噸。當(dāng)年全國秸稈利用量約6.22億噸，綜合利用率達(dá)到76%，其中肥料化、飼料化、能源燃料化、原料化、基料化分別占29%、27%、13%、4%和3%，剩余的秸稈被廢棄，其中部分被焚燒。目前，農(nóng)業(yè)部門正積極推進秸稈全量化利用措施，先期以解決秸稈禁燒為目的，統(tǒng)籌區(qū)域內(nèi)秸稈全量利用。此后，依據(jù)市場與技術(shù)發(fā)展，引導(dǎo)秸稈全量利用向更科學(xué)與合理的方式進行。如江蘇泗洪縣車門鄉(xiāng)，在可消納秸稈的基礎(chǔ)上，剩余秸稈通過配備農(nóng)機農(nóng)藝融合措施全部進行還田處理，以解決秸稈禁燒壓力；江蘇省太倉市通過新建秸稈育苗基質(zhì)、裹包青貯飼料、生物質(zhì)成型燃料以及秸稈科學(xué)還田等工程，引導(dǎo)秸稈全量科學(xué)利用。

地膜殘膜污染治理力度不斷加大。自2012年開始，國家發(fā)展改革委、財政部、農(nóng)業(yè)部聯(lián)合在我國地膜用量大、殘留污染嚴(yán)重的地區(qū)啟動了農(nóng)業(yè)清潔生產(chǎn)示范項目，重點支持廢舊地膜回收網(wǎng)絡(luò)和再加工利用，建立了“推廣加厚地膜—人工或機械撿拾—分點收集轉(zhuǎn)運—再生加工再利用”治理模式。2012～2014年，國家累積投入近6億元，在新疆、甘肅等10個省（自治區(qū)）的180個縣市開展了地膜回收利用項目，新增回收加工能力13萬余噸，新增地膜回收面積5000余萬畝。此外，農(nóng)業(yè)部于2015年起開展了全生物可降解地膜的試驗示范工作，為從根本上解決地膜污染探索新的路徑。

盡管農(nóng)業(yè)面源污染治理在局部地域、單個領(lǐng)域取得了明顯成效，但是，從總體上看，污染加劇惡化的趨勢并沒有得到根本扭轉(zhuǎn)。這是由于我國農(nóng)業(yè)生產(chǎn)壓力大，20多億畝耕地，每年都不休息地工作；我國農(nóng)業(yè)面源污染治理起步較晚，目前引起水域富營養(yǎng)化的程度和廣度已經(jīng)遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過發(fā)達(dá)國家；由于我國的特殊國情，我們把畜禽糞污、秸稈、地膜以及農(nóng)村生活污水等納入到農(nóng)業(yè)面源污染防治領(lǐng)域。同時，我們還面臨著面源污染理論研究不夠、污染負(fù)荷估算模型缺乏、面源污染治理技術(shù)有待成熟、面源污染防治配套政策尚需完善等問題。我國農(nóng)業(yè)面源污染治理難度遠(yuǎn)超發(fā)達(dá)國家。